Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms