Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms