Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms