Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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DysfQ9ESD7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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DysfQ9ESD7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms