Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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