Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms