Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310002L09RikQ9D7L5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms