Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn23Q9D7D7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms