Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MsraQ9D6Y7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms