Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms