Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms