Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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