Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpusd4Q9CWX4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms