Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot11Q9CWN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms