Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms