Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dis3Q9CSH3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms