Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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