Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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