Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf3b1Q99NB9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Sf3b1Q99NB9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Sf3b1Q99NB9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sf3b1Q99NB9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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