Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms