Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms