Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms