Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms