Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul7Q8VE73 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cul7Q8VE73 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms