Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms