Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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