Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Depp1Q8K2F3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms