Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim68Q8K243 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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