Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms