Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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