Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SbsnQ8CIT9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SbsnQ8CIT9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SbsnQ8CIT9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SbsnQ8CIT9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms