Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Brf1Q8CFK2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf1Q8CFK2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms