Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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