Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E4f1Q8CCE9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms