Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms