Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Atg16l1Q8C0J2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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