Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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