Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp38Q8BW70 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms