Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms