Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Pggt1bQ8BUY9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms