Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms