Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf41Q8BH75 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms