Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms