Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms