Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg2bQ80XK6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg2bQ80XK6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms