Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp8Q80U87 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp8Q80U87 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp8Q80U87 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp8Q80U87 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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