Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Avl9Q80U56 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Avl9Q80U56 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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