Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NischQ80TM9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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