Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms