Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms